第一个高峰
在1995年第43届世乒赛上，年仅20岁的孔令辉夺得男单冠军，登上了运动生涯的第一个巅峰。在这一年，获得了中国明星赛男单、混双，第43届世乒赛男团、男单冠军、混双亚军，爱普生世界明星赛男单冠军，中国大奖赛男单冠军，世界杯男单冠军。
第二个高峰
2000年的悉尼奥运会男单决赛，孔令辉夺冠后亲吻球衣上国旗的一幕让人记忆犹新。曾在1996年亚特兰大奥运会上败给“老瓦”的孔令辉在夺冠一瞬间，更是情绪激动，狂吻国旗，仰天长啸。说到自己夺冠后狂吻国旗的瞬间，孔令辉说对于性格内向的自己而言，这样的表现是绝对的“绝版”，后来自己看了都觉得“不可思议”。“我正常情况是不会这样的，当时已经疯狂了。”
