行踪诡秘“全能神”，指令加密数十层
在A警官看来，“全能神”的邪恶不仅体现在其聚敛钱财、破坏生产，还有其非常诡秘的联络方式。
点对点的联系方式，上下线之间不生枝节，像特务接头一样的传纸条，这些细节被媒体广泛报道。“这都是中下层的常规联络方式，其上层间的联系更为隐秘。” A警官对记者介绍说。
在抓获何哲迅等人后，警方在这些高级头目身上起获了很多手机，“每个人十几部”。手机都是专机专用，A和B联系时，专用手机一，A和C联系时专用手机二，以此类推，哪怕没有通讯工具，也不能用手机一和BCD等人联系。
随着时代的发展，成员间的联系更加诡秘，电子邮箱也粉墨登场。赵维山从美国发回的指令，都是通过电邮传达。这些电邮，由专业的技术人员加密二十多层，接收者通过自己的密码才能破译出来。为此，“全能神”的各级组织中，专门设立了电脑组这一职位。
警察被称“小青龙”
除了绝密的“教主指令”，“全能神”各级头目间的交流也有很多暗语。
如果某个教徒被抓捕归案，头目间就会说此人“住院”了。抓他的公安民警，则被称为“小青龙”。教徒一旦募集来“奉献款”，都会向上汇报说筹到了“大米”，美元是“一等品”，港币就是“二等品”了。某成员如果从外教派拉来有影响力的信徒，就会说拉来了“大件”，发展来的一般成员则被称为“小件”。这些暗语，一般小区头目以上才能知晓。
头目间有自己的暗语，教徒则各显神通创立密码。
专案组曾缴获一个教徒的电话本，前面写着灵名，后面却全是英语字母。请专家破解后，才发现这些字母对应着不同的阿拉伯数字。有的成员记下的号码则连其他教徒都无法破译，其中一人就自创了密码，把每位电话号码都+1书写。
