五级组织到乡村
在“七长老”之下，赵维山设计了九大牧区，分别对应除西藏外的全国30个省市自治区。九大牧区当中，全豫牧区是重中之重，直管河南一省。而其他的牧区，最多者分管5个省份。
牧区之下即为区，对应着现实生活中的地级市。区下设小区，相当于县城和县级市。小区之下则为教会，对应着乡镇区划。小区之下还有小排，企图渗透到最基层的村庄。
通过这种严格的编制，赵维山牢牢控制住了全国的邪教徒。随着教徒越来越多，赵维山的胃口也越来越大，甚至把目标盯住了国家政权。赵维山编写的“教义”中，把中国共产党称为“大红龙”，其终极目的就是推翻现行政府，以建立“神的国度”。
人事晋升靠业绩
在“全能神”的组织架构中，信徒理论上可以上升到监察组成员，成为邪教“七长老”。但作为“全能神”的权力中枢，一般信徒注定绝难到达这个地位，这一点从赵维山的权力布局就可以看出。原监察长何哲迅是赵维山的早期追随者，也是他的死忠粉丝。继任监察长“有灵”也是赵的早期追随者，属于死不回头的信徒。
何哲迅和“有灵”之所以能先后成为“监察长”，跟自己的业绩也有很大关系。在从“常受教”转型到“全能神”的时期，“常受教”信徒群龙无首，就是何哲迅等人从黑龙江奔赴安徽河南等地，把这批信徒发展为“全能神”的信徒，为“全能神”的迅速扩张立下了汗马功劳。
因为邪教以控制教徒思想为手段，最后忽悠教徒奉献钱财来敛财，所以他们高度重视发展教徒人数。为此，他们也制定了严格的考核标准。中下级头目“带领”，主要的考核指标就是发展教徒人数。拉来的教徒人数越多，在组织中的地位也就越高，享受的福利也就随之增多。
争权夺利内讧忙
虽然“教义”宣传信仰神圣，但其内部充斥着争权夺利。
何哲迅被警方抓获后，曾几天几夜默不做声。郑州市公安局的预审专家出现后，就是靠其上层组织内部争权夺利带来的矛盾实现了突破。
预审专家先是调来了何哲迅家里的照片。破败的房屋和形容憔悴的妻儿，让何哲迅抱头痛哭。他抛妻弃子跑去“传教”，让家里失去经济支柱，整个家庭濒临崩溃。虽然明白欠家里人太多，但何哲迅还是拒不交代。
最终，预审专家抛出了杀手锏，“你对赵维山忠心耿耿，监察长为啥被撤了呢？”听到这里，何哲迅沉默良久。他想了很长时间，然后开始对预审专家诉苦。
“我这么尽心，最后被撤了，很不值。”何哲迅告诉预审专家，自己和“有灵”一直在争夺监察长的位置，赵维山也利用这个来控制二人。随着何哲迅势力逐渐坐大，赵维山感觉不好控制，就指使“有灵”、“全心”等人告何哲迅的状。随着“诬告信”越来越多，赵维山指令把何哲迅撤职，由“有灵”接任监察长一职。
权力核心如此争斗，中下层教徒更是如此，其权力争斗连绵不断。
