质疑 经费来自烟企如何自律？
杨功焕表示：“我们都知道，一个科学研究要公正的话，不可以拿企业经费来做，而谢剑平所在研究院直属烟草公司，几十项研究都是烟草业界资助的，在这方面怎么自律？”
她指责谢剑平拿烟草业的钱做研究，公正性难以让人信服，客观上起到帮烟草公司营销的效果。“国际上包括世界卫生组织，把拿烟企钱做研究的人都列入黑名单，予以公布。而我国确实有不少烟草企业拿钱收买科学家”。
“我并不是说研究烟草的人就不能当院士，但他研究的是降焦减害，这会误导老百姓吸烟，帮助烟草企业卖烟”，杨功焕介绍，“低焦油”成为很多卷烟厂主打品牌的营销策略，而近几年我国卷烟销量一直增长，公众误以为真的低害，反而吸得更多，减少了戒烟意愿。
就在前天，疾控中心受卫生部委托，正式发布《全球成人烟草流行病学调查中国报告》。调查发现，我国有85%的人不知道，或干脆认为低焦油香烟少危害，甚至医生、教师等高教育水平人群的错误认识比例更高。
资料显示，除烟草公司经费外，谢剑平还主持、负责过国家科技部、自然基金委等资助的重大项目。“在国外，政府绝对不可能拿钱资助这样的研究”，新探健康发展研究中心主任王克安认为，这项研究不仅不能保护人民健康，反而可能增加吸烟者数量。
谢剑平该不该当选院士？
质疑焦点最后落在这里：谢剑平应不应当选院士？
“这是中国科学界的耻辱！这是中国工程院的耻辱！”在微博上，杨功焕连用两个感叹号加“耻辱”，表达对“烟草院士”谢剑平当选的惊愕。她表示，是我们参评院士群体不了解全球健康研究的进展，集体“无知”，还是因为其他原因而“劣币驱逐良币”？
谢剑平所在学部，在工程院9学部中规模最小，除资深院士外剩余34人，只需2/3投票通过即可，相比其他学部更易当选。同时，该学部大部分为环境、气象、海洋等领域专家，与烟草科技相距较远。
“如果放在医药卫生学部，肯定不可能当选”，王克安认为，因此研究关涉健康，更合理的方式应有医药卫生学部相关专家参与评审。但目前仅工程管理学部候选人会放到相关学部，其余均由本学部内部选举产生。
据公开资料显示，谢剑平2007年、2009年、2011年连续3次以“部位遴选”方式参选，即由所在单位提名，报送归口部门，前两次分别止步于第一轮、第二轮评审，这次终于笑到最后。
“院士评选机制有很多漏洞”，方舟子认为，每间隔两年评选，“回炉”院士多，新增院士质量贬值，且目前的选举方式易导致各机构包装候选人、大肆活动、造势炒作等现象，“国外院士选举，被提名者自己都不知道，内部推举然后投票，其他机构很难掺和进来”。
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